Différence entre R MarkDown et R NoteBook

J’essaie de comprendre à un niveau élevé quelles sont les différences entre RMarkdown et R NoteBook . Je sais qu’ils sont interdépendants mais je voudrais comprendre comment ils sont liés. Ma compréhension est la suivante:

Je sais que les livres RNote sont vraiment des documents R Markdown mais je suis confus au sujet des terminologies.

RStudio nouvelle option de fichier a à la fois RMarkdown et R NoteBook et en sélectionnant l’un d’eux ouvre un fichier RMarkdown mais avec des différences mineures. Donc, juste essayer de comprendre pourquoi il y a deux options et quelle est la différence entre les deux?

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Je crois comprendre que les ordinateurs portables R sont nouvellement introduits et que R Makrdown est présent depuis longtemps. Une partie de la confusion pourrait être due au fait que je n’ai jamais utilisé RMarkdown avant l’introduction de R Notebook, donc ma question liée ou plus spécifique est

Que fait R NoteBook différemment que d’utiliser R MarkDown ou quelles sont les nouvelles fonctionnalités apscopes par R NoteBook?

Tous mes résultats sur la recherche Web indiquent que R Notebook utilise R Markdown, mais je n’ai trouvé aucune aide sur ce qui est spécifiquement différent entre les deux.

Pour autant que je sache et de ma configuration, il n’y a pas de différence de codage. La différence réside dans le rendu. L’extension du fichier est la même.

Lorsque vous créez un nouveau Rnotebook, il ajoute html_notebook dans l’option de sortie de l’en-tête. C’est la différence. Vous pouvez alors prévisualiser le rendu rapidement sans avoir à le sortingcoter. Il actualise également l’aperçu chaque fois que vous enregistrez. Cependant, dans cet aperçu, vous n’avez pas la sortie du code (pas de chiffres, pas de tableaux ..) (du moins dans ma configuration). Sans htm_notebook dans la sortie, il n’y a pas d’aperçu de bouton

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Comme vous pouvez le voir, les options de prévisualisation apparaissent, mais vous pouvez aussi le sortingcoter dans le format de votre choix. Cela l’appenda au code d’en-tête lorsque vous le faites.

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Cependant, si vous n’avez pas ce fichier HTML dans votre en-tête, vous pouvez seulement sortingcoter votre code pour voir à quoi il ressemble (le livre entier) (veuillez ignorer l’option par défaut supplémentaire que j’ai ajoutée avec l’image).

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et l’option de prévisualisation ne s’affiche pas dans le menu déroulant

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Sinon, cela fonctionne de la même manière. Pour certaines configurations par défaut, la sortie est également masquée par defaut dans la section code.

Notez que vous pouvez mélanger plusieurs options de sortie dans votre en-tête afin que vous puissiez conserver l’aperçu et conserver vos options de sortingcot pour l’exportation.

Récemment, j’ai trouvé cet article qui m’a rendu clair sur le problème R Markdown vs. R Notebook. http://uc-r.github.io/r_notebook

Voici quelques lignes pertinentes:

Ecrire un document R Notebook n’est pas différent d’écrire un document R Markdown. La syntaxe du bloc texte et code ne diffère pas de ce que vous avez appris dans le didacticiel R Markdown. La principale différence réside dans l’interactivité d’un ordinateur portable R. Surtout que lors de l’exécution de morceaux dans un document R Markdown, tout le code est envoyé à la console en une fois , mais dans un carnet R, une seule ligne à la fois est envoyée . Cela permet à l’exécution de s’arrêter si une ligne génère une erreur.

Il y a aussi cela sur sortingcot vs aperçu lorsque vous créez un carnet R dans RStudio:

L’aperçu vous montre une copie HTML rendue du contenu de l’éditeur. Par conséquent, contrairement à Knit , Preview n’exécute aucun segment de code R. Au lieu de cela, la sortie du bloc lors de la dernière exécution dans l’éditeur est affichée.

J’espère que vous le trouverez utile.

La différence est que, dans R Notebok, vous pouvez écrire des blocs de code Markdown et R-code, les exécuter directement et voir les résultats immédiatement. C’est un peu un cahier pour vous-même.

R Markdown est là pour créer de jolis résultats en HTML, pdf ou un document Word. Combinaison Markdown et R-Code-Chunks. Une courte introduction et la motivation peuvent être trouvées ici .

Si vous souhaitez obtenir plus d’informations sur le paquetage knitr, cliquez ici.

http://rmarkdown.rstudio.com/r_notebooks.html#notebook_file

“Les documents ordinaires R Markdown sont” sortingcotés “, mais les blocs-notes sont” prévisualisés “. Bien que l’aperçu du bloc-notes ressemble à un document rendu R-Markdown, l’aperçu du bloc-notes n’exécute aucun morceau de code R”

Voici une différence pratique que j’ai trouvée:

Lorsque vous devez commenter une partie de texte, RMarkdown insère # dans chaque ligne de votre texte, tandis que RNotebook encapsule soigneusement le texte entre une seule paire de signes (comme dans les fichiers HTML).

On peut dire quelle différence sortingviale. Cependant, à cause de cela, j’utilise toujours R Notebook (au lieu de RMarkdown) dans RStudio pour tous mes documents. Dans tout le rest, ils semblent identiques (au moins pour mes besoins, tels que la génération de fichiers HTML et pdf).

Sinon, mes commentaires deviennent soudain des en-têtes, comme ci-dessous:

 # This part is commented out, but will show as Heading 1 font text 

De jrnold :

R les fichiers du bloc-notes affichent la sortie dans l’éditeur, tout en masquant la console. Les fichiers de démarquage R montrent la sortie dans la console et ne montrent pas de sortie dans l’éditeur. Ils diffèrent par la valeur de sortie dans leurs en-têtes YAML.
L’en-tête YAML pour le bloc-notes R aura la ligne,

 --- ouptut: html_notebook --- 

L’en-tête YAML pour le fichier de démarquage R aura la ligne,

 ouptut: html_document 

La copie de l’en-tête YAML d’un bloc-notes R dans un fichier de démarquage R le transforme en fichier de démarquage R et inversement. Plus précisément, changer la valeur de la output en This est parce que l’EDI RStudio lors de l’ouverture et le package rmarkdown lors du sortingcot utilise l’en-tête YAML d’un fichier, et en particulier la valeur de la clé de output dans l’en-tête YAML, pour déterminer quel type de document c’est

L’une des différences les plus importantes ne ressort pas clairement des réponses ci-dessus.

Section 3.2.1.3 du livre Bookdown :

Il y a également un élément Restart R and Run All Chunks dans le menu Run de la barre d’outils de l’éditeur, qui vous donne une nouvelle session R avant d’exécuter tous les morceaux. Ceci est similaire au bouton Knit , qui lance une session R distincte pour comstackr le document.

En d’autres termes, le sortingcot crée un nouvel environnement et exécute tout le code. En revanche, le bloc-notes R utilise l’environnement global tel quel pour rendre le fichier HTML. En fait, pour un ordinateur portable R, les modifications apscopes au fichier HTML se produisent chaque fois que le document .Rmd est enregistré. Le bouton Preview ouvre simplement le fichier HTML dans son état actuel. Aucun code n’est exécuté. Preview signifie littéralement ce qu’il dit: il vous montre simplement ce qui a déjà été fait.

Pourquoi est-ce important? Par exemple, si un fichier .Rmd R Notebook est ouvert, mais qu’aucun .Rmd code n’est exécuté, le fichier HTML rendra tout le code de démarquage et le code d’entrée corrects, mais aucune sortie n’apparaîtra. Ou supposons que vous définissiez une variable x dans la console, mais pas dans un bloc de code. Si vous essayez d’utiliser x quelque part dans un R Notebook, cela fonctionnera très bien. Prévisualiser le document HTML fonctionnera également très bien. D’un autre côté, sortingcoter le document génèrera une erreur “variable inconnue” car le sortingcot exécute tout le code dans un nouvel environnement, et la variable x n’a jamais été définie dans le fichier de démarques.